La Sede Valdivia entró en funciones en el año 1997 con aportes del Ministerio de Educación, específicamente, la Comisión Nacional de Ciencia y la Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica (CONICYT), a través del Fondo de Fomento al Desarrollo Científico y Tecnológico, FONDEF.
Una de las preocupaciones principales de esta Sede desde sus inicios es su aporte a la investigación aplicada, la generación de conocimiento y la transferencia de tecnología para el sector forestal de las regiones IX al Sur, con énfasis en las regiones IX y X.
Actualmente, cuenta con un staff permanente de 21 personas, 17 de las cuales son profesionales dedicados a la investigación en diversas áreas de especialización, 60% de estos profesionales cuentan con estudios de post grado (grados de Msc. y Dr.) en diversas Universidades extranjeras. Entre los investigadores hay especialistas en Inventario y Monitoreo, Genética Forestal, Manejo, Planificación estratégica, Biometría, Silvicultura, Sistemas Geográficos de Información, Modelos de Datos Geoespaciales y Teledetección.