El proceso de planificación estratégica ha permitido identificar cinco grandes áreas de investigación en las cuales el Instituto Forestal concentra sus esfuerzos, teniendo en consideración la misión, las orientaciones generales establecidas por el Gobierno y las metas propuestas para el sector. Estas áreas son:
| Restauración de Ecosistemas | |
| Economía y Mercado | |
| Industrias | |
| Bosque Nativo | |
| Plantaciones Forestales |